宁夏医科大学前身是1958年建立的宁夏医学院。1962年改称宁夏大学医学系。1972年，上海铁道医学院搬迁至银川，与宁夏大学医学系合并重建宁夏医学院。2002年，宁夏卫生学校、宁夏护士学校并入宁夏医学院。2008年8月，学校更名为宁夏医科大学。2014年，宁夏师范学院医学院并入宁夏医科大学，至此，宁夏医科大学成为宁夏唯一一所高等医学教育学府。
学校有雁湖、双怡两个校区。设有13个教学机构，11个教辅科研机构，具有较为完善的大学医院系统，有12所附属医院（直属附属医院2所，直属附属专科医院3所），17所教学医院，50余所实习医院和实践教学基地。其中总医院是宁夏规模最大的综合性三级甲等医院，是区域性的医疗、科研、教育、考试和培训中心，医疗服务辐射宁夏全区和内蒙、甘肃、陕西等毗邻地区。附属回医中医医院是自治区唯一的公立回医医院，是国家中医药管理局重点建设的三级甲等民族医医院。
学校现有教职员工及医护人员7400余人（含直属附属医院），其中专任教师866人，副高以上职称674人。教师中有双聘院士1人，研究生导师532人（其中博士生导师29人）。全日制在校生8927人，其中，博士、硕士研究生1778人，留学生347人。
学校坚持“艰苦创业、自强不息，开放办学、内涵发展，强化特色、注重创新，全面提高教育质量和效益”的办学理念，有医学、理学和管理学3个学科门类，形成了以医学为主，中西医并存，多学科协调发展的学科专业体系。开设有21个本科专业，其中临床医学、中医学、预防医学、护理学、药学为国家级特色专业，有5个自治区级重点专业群。目前，拥有3个一级学科博士学位授予点，8个一级学科硕士学位授予点，5个专业学位授权单位。2010年成为国家教育体制改革研究生教育改革试点项目高校。
“十二五”以来，学校共承担各级各类科研项目3353项，其中国家级科研项目444项，研究经费达3.16亿元。学校坚持开放办学理念，重视与国内外高校的交流与合作，先后与15个国家或地区的近30所院校和科研机构建有友好合作关系，广泛开展人才培养与科研交流合作。
学校依托民族地区优势，积极开展回医药教育与研究，回医药逐步形成了科研、教学、临床及文化交流为一体的办学特色。
目前，宁夏医科大学已发展成为一所规模、结构、质量、效益协调发展，在全国同类院校中有一定影响力和知名度的高等医学院校。“十三五”期间，学校将不断加强内涵建设，突出办学特色，提高办学水平，为实现“两个一流”（西部一流、有一流学科）和建设西部地区有特色、现代化、高水平的教学科研型医科大学继续努力。
